Jednym z przykładów, gdzie wymagana jest binarne drzewo binarne partycje przestrzeni w grafice komputerowej
http://en.wikipedia.org/wiki/Binary_space_partitioning
Potrzebny jest drzewo binarne, ponieważ algorytm wymaga zachowania relacji między węzłami w drzewie binarnym. Istnieje wiele innych algorytmów, gdzie struktura drzewa jest ważne, a więc stolik hash nie jest odpowiednią strukturę.
Innym dobrym powodem korzystania binarne drzewo zamiast tabeli mieszania jest, kiedy nie można łatwo wygenerować wydajnego mieszania dla swoich elementów danych, ale można wygenerować funkcję porównawczą.
Często do prostego przechowywania i udostępniania danych tabeli mieszania jest bardziej optymalny, ale bardziej skomplikowane do wykonania.